Ben je me réponds à moi même.
Il semble que la taille maxi d'un fichier soit de 80Mo, le transfert ne peut se faire que par FTP.
En transfert par script php, le taille max est beaucoup plus petite: 2Mo.
Cette limite est dû à la config de php, très très conservatrice, à l'heure du Web 2.0, c'est bien dommage...